本项目属海洋技术领域。在“长江经济带”作为国家战略，国家高度重视生态环境保护，明确长江经济带 “生态优先、绿色发展”的总体战略背景下，针对长江经济带末端、陆海统筹最关键的区域——长江口区域的污染物监测、生态系统评价、生态系统管理等问题，项目组在国家863计划、上海市科研计划、上海市908专项、国家海洋局青年基金等10项科技项目以及“长江口生态监控区监测”业务化专项监测工作资助下（总金额1340.35万元），系统开展了长江口盐淡水区域水质检测方法、河口生态系统健康评价及生态系统管理模式的创新性研究与应用，取得多项理论突破和技术方法成果。项目系统梳理了海洋环境评价技术发展的三个阶段，从最初的海洋环境质量监测与污染评价（单纯环境污染指标体系），发展到海洋生态  系统健康评价（融入自然生态系统指标体系）、再到目前的生态系统健康指数评价（纳入相关社会指标体系）的过程。以问题需求为导向，解决了长江口盐淡水混合水域主要污染指标的检测方法、提出河口区水质基准；研究了生态评价指标体系、富营养化评价和生态系统健康评价法；提出了生态长江口建设对策和生态化管理方案。主要技术创新内容和特点包括：（1）针对河口区咸淡水交汇，地表水、海水监测方法均不能兼顾，难以开展陆源污染物陆海统筹的难题，开展了河口水体化学检测方法与评价标准研究，对陆海污染物的代表性指标化学需氧量和无机氮在河口水体中的监测方法进行研究。提出了适合长江口咸淡水交汇区水域的COD 和无机氮检测方法和长江口水质环境基准。（2）针对长江口海域开发利用和生态系统保护矛盾，保障长江口资源环境可持续发展，开展了系统的典型河口生态评价方法研究。首次系统构建了河口生态系统健康评价指标体系与方法，开发了国内首个生态系统健康评价软件；首次提出河口景观生态学学科，利用生境破碎化理论与方法开展长江口大型工程对河口生境的影响研究；首次提出生态长江口概念，构建了涵盖社会、经济与生态经济的六大方面生态长江口评价体系，并开展了示范应用。（3）针对长江口生态监控区管理问题，开展了典型河口生态系统管理模式研究。首次对生态重要性区域的区划方法进行研究，提出海洋生态化管理模式与方法，开展了重要性海洋生态区域的区划方法研究、海洋生态化管理的监控区系统设定原理与方法研究。项目为构建以生态系统为基础的海洋区域管理新模式奠定基础，便于管理部门及时制定建设对策与管理措施，更好的保护上海海洋生态环境，降低生态风险，促进海洋经济持续健康发展。对其他海洋生态环境保护及生态建设工作开展具有重要技术指导意义。项目提出的河口区水质监测方法、河口生态系统健康评价方法等已经用于上海市、东海区海洋环境监测业务化工作，生态长江口建设思路用于“海上城市（奉贤）项目海洋环境影响初步研究”。项目实施共获得61篇论文（其中SCI/EI2篇），出版专著1本，制定企业标准1项，研发GIS系统1个