公共卫生问题不仅仅是卫生问题，事关国家安全和城市安全，没有足够强大的疾病防制系统，即意味着国家的安全设防不严密。鉴于疾病防制系统的重要性和中国疾病防制系统中存在的一系列问题，复旦大学郝模教授领导的研究组自1998年始，在国家杰出青年科学基金(批准号：79925002)等项目的资助下，针对疾病防制系统(包括各级CDC、社区卫生服务中心、乡镇卫生院和村卫生室)，研究和论证了中国疾病防制系统存在的关键问题、成因和障碍，并提出解决问题的策略与方案。1.针对疾病防制系统面临的关键问题、严重程度及危害，利用Meta分析、多维度组合系统评价等方法，认为疾病公共产品提供功能偏废是首要问题，具体表现为重有偿服务轻无偿服务、重收益多轻收益少，由此引发公共产品提供难以落实或流于形式，面临危机(SARS)时反应迟缓。2.研究疾病防制系统面临关键问题的根源(障碍)与形成机制。政府对公共产品组织和提供职能缺位，表现为投入总量不足、投入方式低效(两者归因77％-86％)和市场规范缺乏(归因13.9％-23％)。研制了社会互动-疾病防制功能难以落实的根源与作用机制模型，用该模型揭示问题及根源与形成过程、产生社会危害和作用程度，以及疾病防制机构对有偿服务的重视程度等。3.提出解决疾病防制系统的治本策略。提出各级政府承担对公共产品常规运作的筹资职能(计划机制)，在原基础上全国约需增加50亿投入，约140万/CDC。在追加投入基础上，以政府按服务质量购买方式投入(各方75．9％认同)，可增加投入效率7.2倍，增加CDC日常运作效率2.6倍(市场机制)。同时，规范有偿服务项目和范围(各方83％认同)。研制并检验了落实疾病防制功能的政策思路模型，该模型能揭示消除障碍、解决关键问题的治本、治标和标本兼治的策略思路及其解决问题的程度。对思路的应用前景，各级政府和卫生行政领导、医院、防保人员等有82.8％认可。同时提出一系列的备选方案：如经费投入和转移；农村地区建立CDC；政府购买；农村医防保有机分离；规范服务内容和项目；规范管理；医药分开潜在影响；三级预防基础的社区市场拓展方案；人力配置标准、仪器设备配置等。围绕上述研究内容，课题组在国际期刊上发表论文38篇，国内发表论文36篇。研究结果陆续在山东、江苏、河北、上海等地进行推广，取得了明显的社会效益，具有重要的理论和现实指导意义。如：①功能定位被2004年修订的《中华人民共和国传染病防治法》采纳。②依据人力配置研究结果被采纳形成了《各级疾病预防控制中心组织编制规定》，依据治本策略和改革步骤研究结果，形成了《关于组建卫生部疾病预防控制局的建议》等，经卫生部递交中共中央编制委员会办公室采纳。③形成了《省、地、县级疾病预防控制中心实验室建设指导意见》，卫生部办公厅和国家发展改革委办公厅以卫办疾控发[2004]108号文联合发布。④在采纳研究结果的基础上，财政部、卫生部形成了《关于疾病预防控制体系建设的若干规定》。该项研究成果获2004年度教育部科学技术进步奖一等奖。